纪录片《激变玄武门》将重新解读并再现中国历史上最扑朔迷离、惊心动魄的宫廷事变——玄武门之变。一千三百多年前的一个清晨，一位年轻人亲手杀死了自己的哥哥。而他的父亲也在这一天蹊跷的主动退下了皇位。在之后的历史上，这位名叫李世民的年轻人有了一个新的名号——唐太宗。
一千多年过去了，唐太宗作为一代明君的功绩毋庸置疑，但在那个充满血腥与诡异的清晨所发生的事情，却一直秘雾重重。一代明君究竟是如何登上皇帝宝座的?本片将以现代史学观点为依据，用相关历史人物的视角，以创新的形式与质感将观众带回千年前的大唐皇宫。讲述事变发生前24小时相关人物所经历的危机与变故，分析造成血案的原因。唱响父子手足间的悲歌，增加一条情感线索。从人性角度出发讲述历史，探讨古代专制制度下人性的异化。
太子李建成与秦王李世民之间的矛盾愈演愈烈，李渊不能再容忍自己的儿子在天下人面前为了未来的皇位明争暗斗，他更害怕史书上记载的那些手足相残的悲剧会出现在自己眼前。然而悲剧还是发生，秦王李世民依旧杀害了太子及齐王，玄武门之变由此发生。
玄武门之变前，大唐天下初定，内忧外患。作为太子的李建成常年深居宫中处理日常事务，不及征战在外的李世民功绩突出。兄弟间的政治斗争已经持续了很久，甚至策划了数起暗杀事件。最终，李建成和李世民的矛盾上升到了图穷匕见的境地，正面对决不可避免。
李渊下旨令李元吉带兵征战突厥，并带走了秦王李世民的得力战将秦叔宝等。面对此等危机情况，李世民召集幕僚商议对策。正在此时，李渊召见李世民解释太白入秦分的天象。李世民被逼无奈，下定决心，计划在玄武门外斩杀李建成与李元吉。
李世民秘密调兵在玄武门，并且用淫乱后宫的借口转移了李渊的视线，李元吉和李建成连夜赶来，但两人并未能阻止李世民，反而被当场射杀。围绕太子之位纠葛多年的兄弟纷争彻底了断。冯立率领兵马为太子报仇，李世民部下出城迎战全部战死，一番激战不已，尉迟敬德以李元吉和李建成的人头悬挂于城门上，众将士心散，东宫军退。
